Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms