Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms