Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefmP08553 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefmP08553 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefmP08553 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefmP08553 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefmP08553 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefmP08553 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefmP08553 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefmP08553 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefmP08553 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms