Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms