Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms