Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01878 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01878 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms