Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01755 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01755 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01755 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms