Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms