Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms