Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkcO88445 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms