Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col5a1O88207 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col5a1O88207 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col5a1O88207 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a1O88207 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Col5a1O88207 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a1O88207 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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