Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtssO70370 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtssO70370 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtssO70370 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtssO70370 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms