Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3aO70157 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3aO70157 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3aO70157 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3aO70157 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3aO70157 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3aO70157 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3aO70157 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top3aO70157 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Top3aO70157 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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