Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrxO55103 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PrxO55103 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrxO55103 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrxO55103 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms