Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms