Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms