Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffbO54788 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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