Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PurbO35295 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PurbO35295 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PurbO35295 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PurbO35295 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PurbO35295 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PurbO35295 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PurbO35295 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PurbO35295 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms