Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn9O35239 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms