Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1aO35134 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms