Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih2O35089 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih2O35089 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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