Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC024978J3QPC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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