Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21797J3QNW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms