Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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