Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930544D05RikJ3QK56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms