Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgxb3G3X9M3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms