Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm28038F7BCN9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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