Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms