Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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