Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms