Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip11E9Q512 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms