Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms