Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms