Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms