Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimd1E9PW74 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms