Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3002E9PW72 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms