Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms