Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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BC035044E0CXF8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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