Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms