Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf217D3YYI7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms