Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms