Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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