Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms