Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms