Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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