Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R2

Spin2d, Spindlin family, member 2D, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2dB1B0R2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spin2dB1B0R2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spin2dB1B0R2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms