Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms