Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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