Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b5A3FIN4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms