Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms